Problema con servidor Linux y web

Tengo un problemilla que a estas horas me esta sacando de quicio.

Estoy subiendo una nueva web al servidor del cliente. Por lo que veo es un servidor Linux, y lo único que he hecho ha sido poner la web antigua en una carpeta y poner la mía en la misma carpeta (docroot).

Es una página flash, y nada más arrancar hace una llamada a un PHP llamado configuracion.php. El problema es que me carga la pelicula y cuando hace la llamada al PHP devuelve un error (capturado) como si no exisistiese el archivo, estando en el mismo directorio que la pelicula flash. Nunca he subido una página de esta manera y estoy bastante perdido.

Detalles por si sirve de algo:

He comprobado mayúsculas y minusculas.
No puedo llamar directamente al php si pongo http://www.dominio.com/archivo.php (por lo menos en mi propia página si puedo).
La otra página también utiliza php y no veo que tenga problemas.

Vamos, que estoy más perdido que yo que se.