No se si esas cifras son las correctas para un disco de 40 Gb.
Las de 60 Gb, tiene un disco realmente de 55 Gb y libres nada más iniciarla, dispones de creo recordar que 47 Gb, no me acuerdo exactamente.
Es completamente normal, la capacidad de los HD se expresa, como multiplos de 1000, pero al calcular el espacio real, teniendo en cuenta que un Kb son 1024 Bytes, el espacio real queda reducido, eso pasa con todos los HD.
La diferencia de espacio entre el real y el que te da como disponible, es espacio que se reserva la PS3.