Probablemente tengas el HBC viejo, con la antigua ID, por eso te salen dos.
Si no te quieres liar, bórralo desde el menú Wii, como tu dices, total, sólo dejas tikets en la memoria, no va a pasar nada por ello...
Si no, siempre puedes usar Any title deleter... pero repito, si no te quieres liar, desde el menú.
Cuando lo hagas, sigue un tutorial llamado "Instalar cios en cualquier Wii" para que te funcione el Uloader.