Problema instalación disco M2 en placa MSI

¿Con qué herramienta hiciste la clonación? Si tienes arranque UEFI, cosa probable, o usas algo como clonezilla que arregle las particiones y demás, o no va a arrancar. Con formato MBR es algo más probable que salgan las cosas bien, pero también puede dar guerra.

Probablemente tendrás que activar la opción de arranque en modo legacy (CSM) en la BIOS, así te aparecerán tanto tus discos SATA como el nuevo, pero si la instalación es clonada de un disco que ahora es UEFI no sé si arrancará o dará un pantallazo azul antes de cargar el escritorio, no me jugaría dinero a ello desde luego.

Saludos

Gracias por contestar @Pollonidas
Mi placa es una MSI Z590-A-PRO y el programa que usé para clonar el disco fue Macrium Software pasando todas las particiones, la verdad si me da pantalla azul taaaampoco me muero por reinstalar pero ya lo hice hace poco y todo va guay, no tenía ganas de reinstalar todo, pero el caso es que no llego ni a eso.
Hice clonaciones muchas veces antes y siempre me fue bien... igual puede ser lo que dices, ayer creo que cambié a modo CSM pero ya tenía tanto sueño que no sé si llegue a testear si después de reiniciar aparecían los discos o fue algo que toqué antes de irme a la cama y no revisé, lo miraré otra vez cuando esté en casa.

Esta mañana pensando se me pasó por la cabeza si sería alguna protección de estas que llevan las placas ahora secure boot y una vez me pasó instalando un windows en un portatil asus que tenía que ir creando como los discos de arranque en algún lugar de la bios, pero no vi nada así en mi placa.
Revisé por si podía ser un caso de puerto M2 compartido con puertos sata, pero en el manual de mi placa pone que el puerto M2_2 comparte con el SATA2 y el M2_3 con los SATA 5 y 6, pero el M2_1 no comparte con nada que es el que usé, además supongo que si fuera por eso no vería alguno de mis discos en windows, pero desde windows funcionan todos.

Gracias!

@Mildow lo del arranque seguro podría ser la causa perfectamente. Lo de que se compartan recursos del M.2 con los SATA no porque como dices entonces no saldrían ni siquiera en windows, y añado que el primer slot son líneas directas del procesador que nunca se comparten con otros dispositivos.

Es probable que lo puedas arreglar con el disco de instalación de windows volviendo a generar la partición EFI en el disco duro nuevo con un medio de instalación: https://woshub.com/how-to-repair-uefi-b ... windows-8/ PERO yo personalmente te recomendaría, ya que entiendo que estás familiarizado con ello, ir a lo seguro y reinstalar windows. Puedes copiar lo que necesites del disco viejo como secundario después. Yo tampoco suelo tener muchas ganas de ello, pero la pereza es mala consejera.

Y si haces ese proceso de volver a generar los archivos de la partición EFI, te recomiendo dejar solo el disco nuevo enchufado, para minimizar las posibilidades de liarla.

Saludos

EDITO: Por si le vale a otro, no aparecía en la parte de arranque de la bios el disco M2 porque el volumen donde estaba la partición EFI estaba en el otro SSD.. tenía un poco de lio con los discos .

Hago un super resumen por si ayuda a alguien, tu intuición era buena, a pesar de dar ok en la clonación el volumen de arranque tenía algún problema, lo solucioné con diskpart y bcdboot.
Con esto aparecía dentro de la bios en el apartado de UEFI HD BBS Priorities, pero lo curioso viene ahora, la placa supongo que como todas primero tiene el orden general de arranque
Disco duro UEFI
USB
CD
LAN
etc

Luego en la bios disco duro UEFI tiene su propio apartado UEFI HD BBS Priorities, donde puedes seleccionar cual es el primero de todos tus discos de este tipo.

Bueno pues puse el M2 en ese apartado como primero y luego en el general deje como estaba como primera opción Disco duro IEFI, voy a guardar y reiniciar se oscurece un poco la pantalla de la bios como siempre solo que se queda así, espero al rato pulso esc y la pantalla se pone con el brillo normal y puedo navegar por la bios, cancelo cambios reinicio entro en la bios lo intento otra vez y lo mismo, ni mensaje de error ni leches.

Digo bueno, voy a poner primero el usb y después el disco UEFI, intento revisar desde el disco de instalación de windows, pues nada, exactamente igual, si no dejaba como primera opción el disco UEFI y en su apartado como primera opción ponía el disco SSD viejo no me dejaba guardar, intente cambiar otras cosas y todo sin problema era tocar eso y todo el tiempo igual.
Al final 3 am me cansé de jugar con la placa y los discos y vi que si dejaba como primera opción el disco UEFI pero lo desactivo en UEFI HD BBS Priorities y como segunda el USB al no tener nada ya si pude arrancar desde el usb y reinstale el windows de 0.

Ahora en la bios dentro de UEFI HD BBS Priorities no me muestra el M2 pero si que arranca desde el, solo sale otro ssd que tengo solo con datos, no tiene partición de arranque ni nada.
El caso es que funciona perfecto... de momento lo dejó así y cuando tenga más tiempo reviso a ver porque solo aparece ese SSD o lo mismo espero a ver si llega una actualización de bios, la verdad que eso de no poder guardar una configuración nunca lo vi.
Ahora el ssd con el OS viejo lo tengo pinchado por fuera con un adaptador y pasé los datos. No quería esto por no reinstalar mil mierdas y borrar mil cosas que están instaladas en los disco duros normales, como por ejemplo algún juego de gamepass que luego son un coñazo de borrar ya que microsoft crea carpetas bloqueadas que tienes que cambiar permisos etc.
Gracias por las respuestas @Pollonidas