Claro que no te funciona... ni te va a funcionar nunca.
¿Te has fijado en la parte trasera de la carátula del juego, en la zona de arriba? Ahí te aparecen los mandos que soporta el juego, y en el caso del New Super Mario Bros. sólo aparece el WiiMote y el Nunchuk. Sin embargo, en el Mario Kart te aparecen un montón de mandos, entre ellos el Wii Classic (incluso admite el de GameCube si la Wii es retrocompatible).
El hecho de que tengas determinado mando no significa que lo puedas usar con cualquier juego.