En mi universidad, si mal no recuerdo, la matrícula se hace por internet y luego vas a secretaría con el papel impreso y firmado y te lo sellan. Pero claro, creo que esto se hace cuando llevas mínimo un año ahí. Para el primer año yo (que fue hace cinco años, igual la cosa ha cambiado) recuerdo que tuve que ir personalmente a llevar todo el papeleo.
En cualquier caso, mejor llama a la secretaría de tu facultad y pregunta, que no cuesta nada.