Deberias decir q tienes el qoob( q supongo q es el q tienes al decir q tienes la version 1.3c ¬¬). No tengo el qoob asiq no se exactamente q te pasara. Si el disco gira cuando metes el segundo disco pero no lo lee, puede ser problema del DvD. Si el DvD ni intenta girar esq tienes mal el conector de la tapa.
Para comprobar si es lo primero, simplemente mete el DvD 2 y si lo lee bien, de paso puedes probar un metodo de "arreglarlo". Intenta grabar justo antes de donde te pide el DvD y luego empieza con el DvD 2 y carga la partida, eso funciona en algunos juegos multidisco.
Si es lo segundo q supongo q sera lo q te pasa lo q tines q hacer es asegurarte de q el interruptor de deteccion de cierre de tapa esta bien. Es decir la consola tiene q detectar q abres y cierras la tapa, si tienes puenteado el interruptor .... pues pensara q esta siempre cerrada con lo q no girara, y si lo tienes siempre desconectado ni empezara a leer xD. Tienes q dejarlo enchufado como venia al los interruptores traseros o ponerle un interruptor ^^.
Si no es esto ultimo... pues no se, creo q el qoob soportaba DvDs multidisco perfectamente, puedes probar con la Gcos a ver si te funciona.