HHHmmm, estas hablando de un APU, pero ¿cual modelo exactactamente?
Tambien, ¿usas solo kodi u otro software reproductor?, si es asi ¿tambien ocurre con ese otro reproductor?
¿Has porbado actualizar el software reproductor?, igual ¿has actualizado el controlador de video?
La decodificacion del video, ¿es por software [uso solo del procesador] o por hardware de video [en el reproductor activas DXVA para que el GPU haga el trabajo]?
Yo uso un APU A10 5800K y un A10 7850K ambos solo empleando el video integrado del APU y nunca he tenido problemas con videos, tanto en decodificacion ñpor software [uso solo de los nucleos del procesador] o por hardware de video [uso de los nucleos del procesador grafico], y esto usando tanto video h264 codificado a 1080p incluso a 10bit, asi como video codificado a h265 de tambien ha 10bit [como el procesador grafico no tiene soporte a h265 la decodificacion en este caso es solo por software].
El formato que mas recursos de procesador requiere es el h265 y aumenta mas cuando usas 10bit para el color.
.