Buenas creo que el problema es que estas usando la 3ds con el firmware 8.x para actualizar el flashcard y no puedes debes usar creo una nintendo ds o lite etc.. que no te este bloqueando el flashcard y desde esa consola actualizar el flashcard a la ultima version, luego la metes en la 3ds y deberia de irte.
Eso si siempre que el el r4 que as comprado tenga firmware compatible con el 8.1.0-19 eso lo veras en la web del fabricante del flashcard sino lo tiene tendras que esperar que lo lanzen