Pues si, tiene toda la pinta de ser problema de los cartuchos. Intenta limpiarlos sin abrirlos, pasale un trapo a los conectores con algun tipo de liquido de limpieza. Si no se te quita asi, abre los cartuchos si tienes un destornillador gamebit, y sino te puedes hacer uno a partir de un destornillador de relojero (hay un tutorial por aqui, yo hice uno y funciona).
Si así y todo no se te quita el problema, intenta pasarle un pincel seco al conector de la SNES, por si tiene basurilla.
Espero haberte ayudado, un saludo.