Eso puede ser que tengas petado el disco duro, o que tengas algun virus, porque a mi me pasaba de antes en el otro disco duro, de vez en cuando se petaba, y al reiniciar, me decia que no tenia formato, si lo dejaba un dia sin encender y despues lo encendia me volvia al estado normal, y todo bien, pero no se porque era, ahora tengo otro disco duro y no me pasa. Si eso es lo que te sucede, prueba a poner otro disco duro como maestro y pasa los datos que tengas tan importantes, asi tienes una copia de seguridad, de las cosas esas tan importantes. Suele ser importante tener alguna copia por ahi, que sino... se puede liar gorda, he visto casos de gente que con el trabajo de fin de carrera han venido desesperados a donde hacia practicas para recuperar datos porque el disco estaba petao, asi que ten cuidado.
Un saludo.