estan como bien te han dicho en tu directorio donde se guarda el perfil, en la carpeta crhome, y son archivos .jar. Y creo que borrandolos directamente si se desistalan, en caso que no sea asi, hechale un ojo al chrome.rdf (abrelo con el bloc de notas, por ejemplo) y recorta lo que haga referencia al theme en cuestion. De todas maneras me parece que todo esto ultimo no es necesario.