¿Esto te sirve?
Los ficheros .bashrc permiten ejecutar comandos automáticamente al hacer login. ~/.bashrc (o ~/.bash_profile) se ejecutará cuando TU hagas login.
Si quieres que un alias, un export o cualquier otro comando se ejecute al hacer login cualquier usuario, mételo en /etc/bashrc.
Yo hago que me cargue al iniciar mi alias el Xbindkeys. Supongo que tu podras hacer lo mismo con el vnc ...