Como ya te han dicho el lector es 100% necesario. Aunque en realidad lo único que importa es al menos la controladora del lector funcione y este conectado.
Si tu problema es desgaste del lente, suciedad, daño en el engranaje o motor (bajo ciertos casos), pero la controladora aun funciona entonces podrás cargar por USB.
La mejor prueba es que ejecutes un canal oficial de Nintendo (por ejemplo el canal Mii) si te devuelve un error entonces no hay nada por hacer, pero si funciona sin problemas entonces puedes usar los USB loaders.
