Has probado borrando los archivos de configuración que ese emulador tenga, a ver si hace algo?
Por otra parte, prueba a mirar en el visor de sucesos de Windows a ver si dice algo más de info acerca de qué es lo que produce que el emulador falle.
Si no, solo se me ocurre ser drástico y "amputar" (es decir, reinstalación limpia del windows y volver a probar suerte).
Ah, si tienes un inglés más o menos fluído, prueba a preguntar en los foros oficiales de pcsx2. Son bastante cracks y seguro que pueden arrojar algo más de luz. Eso sí, pon de primeras toda la información que puedas, si puedes incluso con capturas de pantalla del fallo, etc. Que vean que tienes interés en participar activamente en solucionar el fallo y no solo "esto no chuta... arregládmelo, minions" porque en esos casos sí que suelen pasar del que pregunta como de la mierda, jejeje (y con razón).
Espero que consigas solucionar el error, un saludo.