Buenas,
Por favor, lanza el comando diskutil list en Terminal y pega la salida. Una salida normal en un disco sin bootcamp tiene este formato:
MacBook-Pro-de-:~ #$ diskutil list
/dev/disk0
#: TYPE NAME SIZE IDENTIFIER
0: GUID_partition_scheme *250.1 GB disk0
1: EFI 209.7 MB disk0s1
2: Apple_HFS Macintosh HD 249.2 GB disk0s2
3: Apple_Boot Recovery HD 650.0 MB disk0s3
Creo que si lo haces encontrarás dos particiones EFI, siendo la segunda la de la partición de Bootcamp.
Edit: al pegar la salida no respeta la tabulación, pero vamos, te haces una idea.
Edit 2: Si el problema es que la partición de Bootcamp está mal creada, que es lo más probable, puede arreglarse fácilmente, pero antes de tocar nada haz una copia de seguridad del disco completo con la Utilidad de Discos y guárdala en un disco externo usb. Pega primero la salida de la consola y luego vamos viendo poco a poco, pero no uses ninguna otra opción del comando diskutil que no sea list.