Tienes que usar el Wad Manager(o el Wad Uninstaller) para borrar los wads que tienes instalados que te ocupan la Nand innecesariamente OJO con lo que borras,por que puedes provocar un brick si borras algo importante para el funcionamiento del sistema.
Aparte de eso no te pongas a instalar wads a lo bestia o te acabaras encontrando con un problema como el que has tenido ahora.
Un saludo.