Hombre, puede ser que en tu caso sea otra cosa...desde luego, hasta donde yo se la pila precisamente estaba para estos temas, y en un cartucho de Snes puede deberse perfectamente a que se haya agotado.
De todas formas, tampoco lo descartes en un juego que tenga 5 ó 6 años....al igual que las baterias, las pilas no tienen un desgaste homogeneo y ademas tienes que pensar que quizas el cartucho tenga una pila que lleve 2 años en un almacen, mas otro año dentro del cartucho, mas 5 ó 6 años en tu casa...tu tienes le juego hace 5 años y la pila tiene 8 ó 9....
No digo que sea tu caso concreto, es una hipotesis, de todas maneras yo te puedo decir que he tenido que cambiar alguna pila en cartuchos de Snes por este problema....sin embargo tengo alguno desde que salió (p.e. Castlevania IV) y nunca le he tocado la pila.