Problemas con mandos PSX en FreeMcBoot

Tengo dos mandos de psx en la ps2 y funcionan sin problemas salvo en juegos cargados desde HDD con usb que los mandos dejan de funcionar, sabéis porque puede ser?
prueba de jugar el mismo juego por las 2 vias para asegurarte que es por culpa del usb
será porque algunos juegos solo admiten lso dual
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