Si ya tienes un mame funcional, lo que tienes que hacer es decirle al lanzador (en tu caso launchbox) las rutas del emulador y las roms.
El sentido de usar los cores de retroarch es no usar más programas, o en para plataforma con menos emuladores independientes (Raspberry Pi), pero en un pc tienes más para elegir.
Como desventaja, que tienes que configurar cada emulador.
Lanzadores tienes bastantes. Algunos ejemplos:
Launchbox, mala, attract mode, retrofe, hyperspin, ... Y siguen saliendo nuevos.