te paso los comandos que pueden serte necesarios para hacer que todo vuelva a la normalidad
Desactivar Spotlight:
sudo mdutil -a -i off
Activar Spotlight:
sudo mdutil -a -i on
sudo mdutil -E /
/:
Indexing disabled.
sudo mdutil -i on / /Volumes/*
/:
Indexing enabled.
/:
Indexing enabled.
si todavia te da problemas de indexado, cosa que dudo... deja el Mac 24h encendido (sin que entre en reposo)... mejor si puedes dejarlo todo un fin de semana de final de mes para que ejecute cada madrugada todos los procesos programados en las tablas de cron.
saludos!