te recomiendo que uses el fceux y te olvides de historias, por varias razones:
1) para cargar wads de otras regiones tendras que usar una nand virtual, bien con wiiflow, o con uloader, y algunas opciones mas hay
2) tanto el fceux como el wi mednafen se ven muchisimo mejor que los wads de nes de la consola virtual, que por algun motivo se ven tremendamente oscuros
3) por catalogo con los wads estas limitado a lo que se puso a la venta en su dia, que no es poco, pero con los emuladores tienes todos los juegos y aparte ocupando muchisimo menos espacio tanto en la nand real (que no recomiendo instalar nada a no ser que sea totalmente necesario) o en la virtual, donde ocupan muchisimo mas que una ron normal
otro posible problema es que el cable rgb puede que no te funcione, ahora mismo no recuerdo si los wads de nes ntsc se podian forzar a pal60, si se puede las veras bien y si no las veras en rojo
pero respondiendote a la pregunta, necesitas uloader o wiiflow para cargar wads de otras regiones, ya que por alguna razon hay muchos wads incluidos los de nes, que no funciona lo de cambiarles la region o ponerlos en region free, no te van a ir si los instalas en la nand real con wad manager.....
otra opcion es pillarte los wads pal, pero imagino que si quieres los ntsc es porque no te quieres comer los 50 hz