Lo primero es un comando para instalar desde los repositorios exclusivamente, no sirve siquiera ni para instalar un paquete en formato .DEB descargado desde una web.
Sobre los pasos para compilar e instalar un programa puede variar según el que lo programó, así que es importante saber de que programa hablamos. A veces hay que crear una carpeta "build", en otras usa "cmake" en vez de ./configure así que habrías que ver.
De todas formas, si es un programa conocido puede que lo tengas en repositorios alternativos (que sería añadir el repositorio y ya saldría el contenido/programas de este junto al resto) o alguien ya haya hecho un paquete DEB del programa fácilmente instalable.