¿todo esto te ha pasado justo en cuanto cambiaste el kernel ó poquito a poco utilizando el nuevo kernel? Lo digo porque a mí me pasó una vez algo similar. Poquito a poco empecé a tener problemas con la consola, y algunas cosas básicas fallaban. Fue, creo, porque no hice el "depmod -a" lap rimera vez que arranque con el nuevo kernel.
Casi seguro que no es eso, pero bueno.
Un saludo.