Problemilla al compilar kernel

Tengo una Debian 3.1 y cuando le compilo un kernel nuevo (el 2.6.15.1) arranca todo perfectamente pero cuando va a ejecutar los scripts correspondientes al nivel de arranque me dice

"Give root password (or type Control-D for continue)"

Si presiono Control+D arranca bien y no hay problemas, pero quisiera no tener que hacerlo cada vez que arranco.
¿Alguien sabe qué tengo que tocar para que no me pase esto? Porque tengo otro ordenador con otro 2.6 compilado y no tiene problemas.
Muchas gracias a todos.
¿No te dice nada antes de tu sistema de archivos?
Seguro que antes de lo de Ctrl+D dice por que
tiene que hacer mantenimiento puede simplemente
que te falte en el kernel soporte
para algo ... (o que le has compilado como modulo aunque
debias dejarlo en el kernel)
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