Entonce prueba a ver si tienes una entrada que habra esa ventana en el registro:
HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Run
mira entre todas esas entradas a ver si encuentras alguna que pueda abrir la carpeta c:\windows en ese caso y si estas bien seguro de que es esa eliminala. Digo que solo si estas bien seguro de que es esa pq si eliminas otra vete tu a saber lo que no te arrancara la proxima vez que arranques
