Pues claro que no te funcionan los backups ,
has actualizado a un Firmware Oficial de Sony y por tanto has eliminado el Custom Firmware (presumiblemente M-33) que te permitía leer los backups desde la tarjeta.
Solución
Debes de instalar de nuevo en la PSP con un Custom Firmware (Vamos customizarla para que lea de nuevo backups), para ello necesitas una Memory Stick Mágica (Preparada con el Despertar del cementerio te aconsejo la versión 8) y una bateria Pandorizada.
Por el foro hay tutoriales de como hacerlo.
Saludos