Pues protesta, porque si en el las condiciones para aprobar la asignatura pone expresamente que es necesario hacer x exámenes o si es un examen final, pide que se cumpla lo que está estipulado.
Si no consta en ningún sitio que se deba hacer ese examen, sintíendolo mucho, te va a tocar aguantarte, aunque lo mismo si lo hablas con la directiva de la universidad se puede hacer algo, pero tendríais que protestar muchos más, porque si es solo uno van a pasar de tí.