Programa para cortar pistas de audio

goldwave o audacity

Mp3 directors cut, además no recomprime

OnLine, puede ser TwistedWave:
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Gratuito Audacity, Sound Forge, Wavosaur free o Acon Digital Acosutica Basic Edition 6, en cualquiera de ellos solo SELECCIONAS el tramo que quieres conservar y lo pegas en un nuevo proyecto [abres un archivo nuevo], esto cuando son pistas largas hechas de diferentes temas [canciones], o bien, si es cortar silencios o partes, solo seleccionas esas partes indeseadas y usas el boton CORTAR hasta dejar solo las partes de sonido que te interesan y guardas.

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Gracias a todos

Audacity

Yo me quedaria con Audacity tal y como han dicho @theelf y @exitfor, es de los mas sencillos y cumple perfectamente con lo que quieres hacer.

Pues a probarlo.
Gracias