Programa para formatear disco duro externo NTFS.

Cualquiera vale. Desde la utilidad que viene en Windows hasta uno gratuito como Easeus Partition. No vas a perder nada de capacidad por formatear, como si quieres formatear medio millón de veces.

Alternativamemte darle formato de bajo nivel, con este borras definitivamente y sin opcion de recuperacion los archivos, borra todo de todo, tabla de particiones, sistema de archivos: TODO. Tarda mucho mas que el formato estandar pero repito BORRA TODO. El formato a bajo nivel o tambien llamado Zero Format es como viene de fabrica un disco duro, es decir no tiene ningun sistema de archivos definido ni particiones ni nada de nada, solo vienen ceros. Ya despues aplicas el formato -aplicar el sistema de archivos- que gustes.

El mismo Disk Manager del fabricante del disco incluye la opcion de formato a bajo nivel, aunque tambien ecnutras software gratuito que hace esat funcion.

http://hddguru.com/software/HDD-LLF-Low ... format.png

No vas a tener mas o menos espacio por formatearlo a bajo nivel o hacer un formateo rapido, que yo sepa (la diferencia es que de cierto modo el formateo rapido no elimina los antiguos datos físicamente).

Y el formato completo (no confundir a bajo nivel) chequea los crusters

Formato rápido, y ya está. No te compliques la vida.

Voy a aclarar un par de cosas, por sea caso.
Windows mismo te formatea en NTFS, formateo rápido, el formateo normal te comprueba los cluster, pero es como que el fontanero te mire el coche.
Pierdes siempre espacio, aproximadamente unos 100 megas o algo menos, para construir el sistema de archivos, pero no es que la pierdas, esta ocupada, no vas a perder nada de capacidad por un formateo.
El formateo a 0 o a 1 se utiliza para que los datos no puedan ser recuperados, y es totalmente efectivo a partir de la vez 15 que se hace, básicamente eliminar algo de un disco por completo te cuesta en torno a las 24 horas, es una Tontería a menos que almacenes secretos de Estado.