¿Qué chip usas?
Yo he tenido varias veces ese problema:copias bien hechas que no funcionan a la primera (la del resident evil casi consigue que tire la ps2 al suelo de la desesperacion).
Mi solucion (esto no es una tesis,ojo):
Yo tengo el chip usb y la action replay2,lo que hago es,al hacer el cambio de cd del de la ar2 al del juego antes de pulsar la x espero hasta escuchar ese sonidillo que hace la ps2 cuando le metes un cd (unos 7 segundos mas o menos),entonces ya sé que me lo ha reconocido y pulso la x.
Desde entonces no me ha fallado ni una sola vez (si el ripeo estaba bien hecho,porque sino ni de coña!!!,claro)
Espero que te sirva.