El proceso de flasheo actualmente es facilisimo.
Si has realizado el proceso y todo ha acabado bien, y te funcionan los originales, entonces has flasheado con exito, y te funcionaran los backups.
Para Ruido:
No te funcionan los backups, porque cometes algun fallo o no los haces como toca.
Yo utilizo el metodo Hotswap, sencillamente porque no kiero tener que usar la consola para realizar el backup, me es mas rapido y me fio mas de los SS que sube la gente.
Y si lo realizas todo bien, sale un backup 100% funcional.