Pues si la memory con el FreeMcBoot la tienes preparada, poco te falta por hacer.
Comprueba que el OPL o el USBeXtreme te cargan bien (eso es lo importante), y lo demás ya es cuestión, como dices, de la compatibilidad del pendrive o del juego.
Si vas a probar varios pendrives o discos duros, prueba con juegos que ocupen poco (como Tekken Tag, que es CD y no DVD), así tardarás menos en instalarlos y en probarlos.