Pues se utiliza muy parecido al CFW2OFW Helper, la mayor diferencia, es que no te descarga automáticamente la actualización necesaria para realizar el proceso, tienes que descargarla a parte, el funcionamiento sería el siguiente:
1.- Ejecutar el programa.
2.- Te pedirá elegir el archivo PKG con la actualización del juego.
3.- Te pedirá seleccionar la carpeta PS3_GAME.
4.- Al igual que el CFW2OFW Helper, te creara dos carpetas con las cuales debes crear los 3 PKG y firmarlos para instalarlos.
Yo personalmente, utilizo siempre el PS3 Game Convert, ya que como dices, varios juegos solo funcionan con dicho programa y al contrario, no conozco ninguno que necesite obligatoria mente el CFW2OFW Helper, saludos.