Hola ye_sansa.
Haber , por lo que yo se , hay dos descargas:
1ª: Homebrew Fixer , que son 5 ficheros (que es para msdos o simbolo del sistema)
2ª: la GUI que han sacado en la cual vienen dos ficheros en Jar y Exe
Tienes que descargarte las dos cosas , y descomprimir las dos descargas en una misma carpeta.
Ejecutas la GUI (eBootFixer.exe) y en ApplicationName le pones el nombre que quieras darle al eboot.pbp que vas a modificar (normalmente sera EBOOT, no es necesario poner extension ), todo seguido se te habrira una ventana para seleccionar el eboot que vas a modificar y le das a FixEboot , entonces se te quedara grabado en la carpeta del Homebrew Fixer el eboot modificado ya listo para sustituir por el viejo EBOOT de la aplicacion que no te funcionaba.
espero haberte sido de ayuda , yo lo he probado y me ha funcionado asi .
Un saludo.