Pones la tarjeta en el adaptador SD, insertas todo en un lector de tarjetas, y cuando aparezca en tu PC, le das con el botón derecho sobre la unidad y a Formatear.
Cuando aparece el diálogo de formatear, en lugar de ntfs o fat32, seleccionas FAT ó FAT16, y en la casilla de TAMAÑO DE UNIDAD DE ASIGNACIÓN, le pones 64KBytes ó 65535 Bytes.
Y a formatear!
Ya dirás qué tal va (así le servirá a todo el mundo que tenga este problema)
Un saludo,