Ayer yo lo hice con el Splinter Cell. Es muy facil. Demultiplexas el PSS con PSS Plex. Downsampleas el M2V. Ahora toca multiplexar con el PS2STR de Sony.
1º Pestaña SPU: añades todos los WAV del video en la lista, eliges donde kieres que se guarden los archivos una vez sean comprimidos y le das a Start (si son los videos de Splinter marca la casilla ADPCM).
2º Pestaña Mux: Añade el M2V (tipo Video), y despues añade el primer SPU (tipo PCM, si es del Splinter Cell usa ADPCM). Despues añade el segundo SPU pero esta vez ponle de nº ID 1, despues con el siguiente SPU y pone de nº ID 2 y asi con todos. Una vez terminado te pedira que guardes toda la configuracion en un archivo .MUX. Una vez guardado el .MUX elige donde kieres que se guarde el PSS final. Dale a Start y fin.