Lo del autoapagado depende del disco duro. Yo tengo varios para el ordenador en un dock externo, que voy poniendo según necesito, y unos se apagan al minuto, otros no se apagan nunca, otros a los 10 minutos...
Depende del fabricante, en algunos puedes modificarlo y en otros no.
La solución sería un plugin que comprobara cada x tiempo la presencia de un archivo, al estilo de lo que hace el dash launch de x360