Eso es un fallo de la luz amarilla(en mi firma tienes un tutorial para intentar arreglarla);la consola puede encender sin el lector conectado,pero no podras ni actualizar ni ejecutar ningun software de la PS3(ya sean demos;entrar al Life o al Home)ni instalar linux a menos que le conectes el lector.
La placa de la consola y la controladora del lector van casadas por una key que debe ser identica en ambas placas,si la consola no detecta el lector aunque encienda no te dejara ejecutar nada y si intentas actualizarla podrias provocar un brick o entrar en un bucle de actualizacion.
Un saludo.