Comprueba primero si los puertos USB tienen voltaje, me paso algo parecido en un portátil los puertos USB dejaron de recibir corriente, lo que hice fue meterle directo los 5v al puerto desde el puerto sata y a funcionar de nuevo, pero vete a saber si te valdrá, por probar no pierdes nada funcionar no te funcionan, desde el cable del lector puedes sacarle los 5v.