Usa Gecko OS, es mucho mejor que BL porque está más actualizado. Como es original no tendrás problemas. Usa la última versión y listo.
En todo caso, si usas mucho juegos nuevos y no quieres estar con Gecko OS siempre, lo mejor es que actualices a 4.0 conservando todo, es decir,
1º Meter HBC y cIOS (imagino que esto ya lo tienes)
2º Actualizar por internet (de forma oficial, sin miedo)
3º Parchear IOS60, hay varias opciones, por ejemplo con DIP-IOS (mira su hilo oficial).
Si quieres mete también BootMii y haz una copia de la NAND para tenerla, antes de parchear IOS60 y si todo sale bien, haces otra copia después.
Con esto, ningún juego pedirá actualizar y podrás jugar truchas con chip desde canal disco, tendrás el menú SD con wads homebrew, etc... vamos, todo menos TH, que con BootMii y Bannerbomb no es necesario.