Te refieres al servidor DHCP, seguramente, que no es lo mismo que el servidor DNS. Lo tendrás activo en el AP y lo tienes que desactivar porque colisiona en el rango de IPs con el DCHP del router. Como regla general en este tipo de configuraciones, sólo debes tener un servidor DHCP. Si realmente quieres tener dos servidores DHCP, es decir, que el AP asigne su propio rango, tienes que asegurar que los rangos en el AP y en el router son diferentes, porque ineludiblemente en algún momento asignarán la misma IP a dos equipos diferentes y tendrás problemas.
Si realmente estás hablando con propiedad y te refieres a que los equipos conectados al AP toman un servidor DNS que no coincide con el del router, tendrás que cambiarlo en el AP y hacer que coincida con aquél. Si no estoy equivocado, poniendo la IP del router como gateway en el AP los aparatos que conecten vía AP te "heredan" los servidores DNS del router.
Saludos.