Aunque lo introduzcas en minusculas, si lo haces correctamente deberias de tener el juego registrado en tu cuenta.
Si estaba ya registrado no creo que tenga nada que ver con que lo introdujeses con anterioridad utilizando minusculas. Mas bien diria que algun espabilao ha abierto el juego y ha registrado el codigo antes que tu. (creo recordar que los codigos VIP de los juegos antiguos venian sin el rasca).
Tambien puede que se trate de algun tipo de error. Creo que lo mejor que puedes hacer es mandar un e-mail al SAC de Nintendo.