Como firmware, 5.00 es el mejor y más compatible. Te permitirá, por ejemplo, jugar a dobles con otra PSP y cargar tus juegos por WiFi, todo esto via IRShell.
D2 no ofrece ninguna mejora en el apartado PSX, y el IRShell ya no funciona, con la pérdida de esas funciones. Pero añade compatibilidad con juegos posteriores al Dissidia, por ejemplo.
D3 es un bug con patas y no se lo recomiendo a nadie. Muchos juegos de PSX, homebrews y hasta juegos dejan de funcionar con éste.
Y todos tienen posploader. Para el primero busca el popsloader de 5.00 M33 y para el segundo, el de 5.50 GEN.
Saludos!