Los discos que modificas, efectivamente son trucha... te recomendaría que dejaras tus juegos sin modificar a partir de ahora y tu amigo que haga lo que quiera... o haces una copia de cada....
Sobre tu pregunta............
¿Cómo empieza tu serial? ¿No será una de esas famosas LU64?
Si es una LU64 no debes hacer downgrade nunca...
Como ya tienes el HC instalado lo normal sería:
- Instalar un cIOS por lo menos.... tienes para elegir; yo optaría por el de Wanikoko, no es el más compatible pero es el más extendido.
- Subir a 4.0 mediante update oficial.
-Usar DOP-IOS una vez estés en 4.0 para parchear IOS60, IOS36, IOS21, IOS37. (Esto sin cIOS no porías hacerlo)
Con eso obtienes 4.0U con trucha activo tanto en los discos como en los IOS más usados.
PD: el disco que usas para configurar el chip se ejecuta en modo GameCube y ahí no existe eso de trucha