a mi me ocurría lo mismo, aunque solo si la carpeta que añadía del disco duro tenia árcades, probé de todo, formateos, tanto del disco duro externo como interno, reflasheados de la nand, diversas versiones del freestyle, intercambios de discos con otra consola con freeboot... y no pude solucionarlo, algún otro del foro también le ocurrió, solo te puedo decir que no es debido al disco duro, es algo entre la consola y el freestyle.
al final opte por poner los árcades en el disco duro interno y en el externo no tener ninguno, ya que en mi caso, cuando había esta dirección "ficticia" el freestyle iba lento de coj*nes.
