Yo lo que haría es:
Comprobar que el cable gigabit lo es teoricamente, osea que se vea que tiene los 8 clabes y en ambos extremos el orden de los colores es el mismo (cable directo, lo ideal para PC<->Switch).
Probar otro cable y puerto del switch.
Probar a conectar el PC directamente al router(si es gigalan).
Si tienes algun portatil con gigalan, probar a ver si se conecta a 1Gbps.
Arrancar alguna LiveCD y comprobar a que velocidad se conecta para descargar que sea problema de software.
Si el cable es largo y/o pasa cerca de fuentes de interferencia, pues tambien puede ser una razon para que sincronice más lento.