Yo antes lo hacia con Mkv2Vob y sin problemas. Si que es cierto que en algunas peliculas se desincroniza el audio. Creo que habia que cambiarle el Framerate pero no me acuerdo bien. Si la consola esta en CFW 3.55 puedes utilizar el Showtime que si lee MKV. Si la tienes en 3.60 mirate bien a cuanto te va acomprimir la pelicula porque ten en cuenta que con un HDD esterno no puedes pasarla en un solo archivo. A una mala utiliza el Ps3 Media server y asi no tienes que andar recodificando ni grabando.