Incluso desinstalando desde 'agregar o quitar programas' te pueden quedar archivos por ahí.
Yo para desinstalar uso Revo Uninstaller (habrán otros quizá mejores quizá peores, siemplemente fue el que vi xDD), que te lanza el desinstalador de windows, y cuando acaba busca restos que se hayan quedado por ahí para que los borres.