Yo respecto a exclusivos para New creo que lo ideal sería que fueran remakes para no perjudicar en exceso a los usuarios con la 3DS, osea, si hay Metroid nuevo por poner un ejemplo, debería ser compatible con todas. Yendo al grano, yo como no disfruté de una Gamecube me encantaría ver en N3DS:
- Super Mario Sunshine
- Zelda: Twilight Princess
- Metal Gear Solid Twin Snakes (probé el de PSX en Vita y creo que ha envejecido mal, éste imagino será mejor)
- StarFox Adventures
- Star Wars Rogue Squadron (Saga)
- Ethernal Darkness
- F-Zero (aunque por el tipo de juego mejor uno nuevo)
- Viewtiful Joe
No he jugado a ninguno de estos pero en su día les eché el ojo en las revistas mientras jugaba a mi PS2. No pongo más porque realmente no cuento con ninguno que no sea de la propia nintendo. Respecto a remakes de Wii, lo veo complicado por el sistema de control que lo veo inmejorable en juegos como Metroid o Skyward además de difícil de portear en el caso de este último. Así que por mi parte de Wii sólo pediría The Last Story o juegos fáciles de adaptar al control.